La SIGA utiliza información cartográfica y alfanumérica en una geobase de datos relacional distribuida a nivel Nacional cubriendo varias entidades del país. Mediante sus módulos, la Geobase de Datos Institucional del Agua (GEOAGUA), administrada por la SIGA, permite procesar información de los recursos hidrológicos de una manera gráfica, haciendo posible consultar las características de estos recursos así como de quienes hacen uso de ellos.

La GEOAGUA se encuentra implamantada sobre un manajador de base de datos relacional lo cual permite administrar grandes volúmenes de información. Adicionalmente es facti ble la administración de metadatos geográficos así como la vinculación a otras bases de datos distribuidas con las que cuenta la CONAGUA.